- Введём координаты с началом в центре основания $O$. Так как сторона основания равна $1$, координаты вершин квадрата $ABCD$: $A=(\tfrac12;-\tfrac12;0)$, $B=(\tfrac12;\tfrac12;0)$, $C=(-\tfrac12;\tfrac12;0)$, $D=(-\tfrac12;-\tfrac12;0)$.
- Найдём высоту. $|OA|=\dfrac{\sqrt 2}{2}$. Из $\triangle SOA$ (прямоугольный): $SO^2=SA^2-OA^2=1-\tfrac12=\tfrac12$, $SO=\dfrac{\sqrt 2}{2}$. Тогда $S=\left(0;0;\dfrac{\sqrt 2}{2}\right)$.
- Координаты середин: $$M=\tfrac{S+A}{2}=\Bigl(\tfrac14;-\tfrac14;\tfrac{\sqrt 2}{4}\Bigr),\ N=\tfrac{S+C}{2}=\Bigl(-\tfrac14;\tfrac14;\tfrac{\sqrt 2}{4}\Bigr).$$
- Направляющие векторы прямых: $$\vec u=\vec{MN}=\Bigl(-\tfrac12;\tfrac12;0\Bigr),\quad \vec v=\vec{BD}=(-1;-1;0).$$
- Найдём вектор общего перпендикуляра: $$\vec u\times\vec v=\begin{vmatrix}\vec i&\vec j&\vec k\\-\tfrac12&\tfrac12&0\\-1&-1&0\end{vmatrix}=(0;0;1),\quad |\vec u\times\vec v|=1.$$
- Возьмём соединяющий вектор $\vec w=\vec{MB}=\Bigl(\tfrac14;\tfrac34;-\dfrac{\sqrt 2}{4}\Bigr)$.
- Расстояние между скрещивающимися прямыми: $$d=\frac{|\vec w\cdot(\vec u\times\vec v)|}{|\vec u\times\vec v|}=\frac{\left|-\dfrac{\sqrt 2}{4}\cdot 1\right|}{1}=\frac{\sqrt 2}{4}.$$
Геометрически тот же ответ получается мгновенно: прямые $MN$ и $AC$ параллельны, а $AC\perp BD$ (диагонали квадрата), значит $\vec u\perp\vec v$. Общий перпендикуляр вертикален, его длина — это вертикальное расстояние $z_M-z_B=\tfrac{\sqrt 2}{4}.$
Ответ
$\dfrac{\sqrt 2}{4}$